上海病原微生物宏基因组 mNGS 检测
适用人群
覆盖31,033种病原体及4,417种耐药基因的宏基因组测序,3天出报告,解决常规检测阴性但临床高度怀疑感染的疑难病例难题。
适用人群
- 不明原因发热超过1周,常规血培养、影像学检查仍无法明确病因的患者
- 重症肺炎使用广谱抗生素治疗3天无效,需快速锁定致病菌的患者
- 免疫缺陷(如HIV、化疗后、器官移植)合并感染,常规方法阳性率低的患者
- 疑似中枢神经系统感染,脑脊液常规、涂片、培养均为阴性的患者
- ICU重症感染病情进展迅速,等不及传统培养2-5天周期的患者
- 疑似罕见或难培养病原体(如分枝杆菌、立克次体、真菌)感染的患者
检测内容
本检测采用宏基因组高通量测序(mNGS)技术,对患者样本中所有微生物的DNA和RNA进行无偏倚测序,一次性覆盖31,033种病原体,包括细菌14,208种(含104种分枝杆菌)、真菌814种、病毒15,720种(DNA病毒12,894种+RNA病毒2,826种)、寄生虫169种、支原体/衣原体97种、螺旋体25种。同时可检出4,417种耐药基因(覆盖31种抗生素)和484种毒力基因,指导精准用药。技术不依赖病原体分离培养,能发现丰度极低甚至痕量的病原体。局限性:无法区分定植与致病,可能因样本污染出现假阳性,未知或新发病原可能漏检,且价格较高,不适合作为普通感冒的一线检查。
检测流程
采样便捷,根据感染部位选择样本类型:血液、痰液、肺泡灌洗液、脑脊液、尿液、分泌物均可。无需空腹,不限制饮食。在上海本地医院或合作采样点完成采集,样本冷链运输至实验室。部分城市支持护士上门采样,具体可咨询客服确认。
准确性说明
检测准确性高,依《ABX指南》和《临床微生物学手册(第11版)》解读报告。阳性结果需结合临床症状、影像学综合判断,高reads病原体更有临床意义,但低reads不能完全排除感染。阴性结果不能100%排除感染,可能因病原量过低或抗生素治疗后抑制。安全无创,仅常规采样操作。报告周期3天,重症急诊可咨询加急流程。报告包含明确病原、可疑病原、可能定植/污染三类结果,辅助临床决策。
详细流程
- 咨询:联系上海客服或临床医生,确认是否适用本检测
- 开具检测申请:由医生根据病情填写检测申请单
- 采样:在上海医院或合作点采集相应样本(血液/痰液/肺泡灌洗液/脑脊液/尿液/分泌物)
- 样本冷链运输:专业物流将样本送至实验室
- 实验室检测:前处理、核酸提取、cDNA合成、文库构建、高通量测序
- 生物信息分析:比对31,033种病原数据库及耐药基因库
- 报告审核与解读:专业团队依据指南出具报告
- 获取报告:3个工作日内线上或医生处获取,医生结合临床解读
检测须知
- 检测前无需空腹或停药,但抗生素使用可能影响检出率
- 采样需严格无菌操作,避免样本污染导致假阳性
- 本检测不能替代常规培养,建议同时进行药敏试验
- 报告需由临床医生结合症状、影像及其他检查综合判读
- 阴性结果不能完全排除感染,可能因采样时机或病原量过低
- 不适合作为普通感冒或自限性感染的一线检查
- 价格较高(3500元),建议用于疑难、重症或免疫缺陷患者
- 样本需冷链运输,具体采样城市覆盖范围请咨询客服
上海可做此检测的机构
常见问题
Q: 我发烧一周了,查不出原因,适合做这个检测吗?
A: 您的情况属于“不明原因发热”,非常符合本检测的适用场景。mNGS 能一次性筛查 31,033 种病原体,包括常规血培养和 PCR 查不到的罕见病原,比如立克次体、分枝杆菌等。报告周期仅 3 天,能帮助临床快速锁定病因,尤其适合常规检查阴性但高度怀疑感染的患者。
Q: 我父亲在上海ICU,因重症肺炎上呼吸机,用了多种抗生素没好转,痰培养一直阴性,这个检测能帮上忙吗?
A: 非常适合ICU复杂感染。常规培养在抗生素使用后阳性率显著下降,而mNGS受抗生素影响较小。本检测覆盖31,033种病原体,包括真菌814种、病毒15,720种,还能检出4,417种耐药基因,指导精准用药。报告周期仅3天,比传统培养更快,适合病情进展迅速的重症患者。
Q: 这个检测能发现像新冠、流感这样的RNA病毒吗?
A: 能。本检测采用DNA+RNA同时检测模式,通过cDNA合成步骤将RNA病毒逆转录后进行测序,因此可以检出新冠、流感、HIV等RNA病毒。同时,它也能检出DNA病毒(如巨细胞病毒、EB病毒),覆盖15,720种病毒(含DNA病毒12,894种,RNA病毒2,826种),适合不明原因发热或疑难病例的鉴别诊断。
Q: 我在上海,检出‘耐药基因’但没做药敏,能直接换药吗?
A: 不能直接换药。本检测覆盖4,417种耐药基因(对应31种抗生素),可提示耐药风险,但不等同临床药敏结果。例如检出aph(3')-IIa提示氨基糖苷类耐药,具体用药需医生结合临床、药敏试验综合判断。mNGS是辅助决策,不能替代传统药敏。
Q: 我采样后3天拿到报告,下一步该找谁解读?
A: 报告出具后,建议您首先咨询送检医生,他们会结合您的临床症状、影像学和其他检查结果综合判断。我们的报告解读依据《ABX指南》和《临床微生物学手册(第11版)》,但最终治疗方案需由临床医生决定。如需二次意见,可携带报告到专科医院感染科或呼吸科咨询。